治疗少精子症的方法有很多，下面列出了常见的五种：
(1)基于内分泌功能异常引起少精子症，关于此症的治疗工作，患者可尝试服克罗米芬可提高精子数，每日25mg，每月服25日，停5日，6～12个月为一疗程。有报道长期服用可降低形态正常精子的百分率，故目前推荐用低剂量疗法，即隔日25mg。也有采用人绒毛膜促性腺激素(HCG)1000u，每周肌肉注射2次，8～10周为一疗程；同时可每日内服维生素E100～200mg，连服3～4个月。也有试用丙酸睾丸酮50mg，每周肌肉注射3次，共3个月，用药时精子数减少或消失，停药后出现反跳现象，但据报道疗效不佳。近来报道用酮替芬(甲哌噻庚酮)1mg，每日2次，连用3个月，精子密度和活动率得到显著改善。己酮可可碱加入到精液中或口服后可使特发性少精子症活力不足的精子增加活力。
(2)精索静脉曲张是引起少精子症最常见的原因，有报告高达39%，可作精索静脉结扎术，术后1年精子密度升高者约50%～80%以上，使妻子妊娠者约30%～50%。
(3)急慢性睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、精囊炎等生殖道炎症也是引起少精子症的常见原因。治疗可用羧苄青霉素每日4克，分4次服，连续使用1个月。复方新诺明可穿入前列腺液，疗效也较好，每日2次，每次2片，连服3个月。
(4)补充微量元素：补锌对少精和死精症有一定疗效，服药后精子数量明显增加。由于锌和铜的拮抗作用，补锌同时治疗高铜。治疗方法是每次口服葡萄糖酸锌50～100mg，每日2次，3个月为一疗程，也有采用硫酸锌治疗的。
(5)补充精氨酸：精氨酸是生成精子的必要成分，少精子症患者的精液中，氨基酸含量明显低于正常男性。补充精氨酸，每日口服4克，连续10周，可以使精子计数提高。
