支原体的并发症有以下几种:
非淋菌性尿道炎：衣原体或支原体引起的尿道炎称非淋菌性尿道炎，解脲支原体是其中一重要的病原体。该病多见于青年，症见尿急、尿痛、尿道刺痒或排尿困难，尿道口有粘性分泌物或痂皮，与淋病相似，比淋病轻，但不能从临床症状上作出鉴别，而须依赖实验室检查。
支原体的危害:
支原体侵入生精细胞，使精子细胞生成减少，
吸附在精子表面，使精子畸形率增加，
干扰精卵识别融合，
支原体与精子存在共同抗原可能引起免疾性不育。
女性不孕：男性泌尿生殖系内的解脲支原体可随精子“搭车”进入女方生殖道，引起子宫内膜炎、输卵管炎、卵巢炎、头号膜炎、自发性流产和宫内死胎等，使生育力受到影响。
