女性感染沙眼衣原体，症状和淋菌性尿道炎非常相似，患者最开始症状轻微有的可能毫无症状，一般经1-3个星期的潜伏期后，外阴部首先发炎，自觉瘙痒，行走时疼痛，相继出现尿道炎、宫颈炎、咽喉炎、直肠炎等症状，其中以宫颈炎最常见。这里出现咽喉炎、直肠炎症状的患者多是有过口交史、肛交史。
女性衣原体感染多数最开始没有症状，有症状的患者中，宫颈炎是最常见的表现，但是大多数患者往往忽略或当做普通的宫颈炎来治疗。有极少数衣原体感染患者有阴道或腹部疼痛、间或出现排尿频繁、尿急、尿痛等尿路感染的症状。有个别患者还会出现性交痛、眼角红肿流水等等。女性衣原体感染若是不及时的治疗，就会继续感染导致出现衣原体输卵管炎、衣原体盆腔炎等等。
温馨提醒：对那些长期抗生素治疗无效或者不在相信抗生素治疗的患者，建议选择无抗药性，无耐药性的中医中药治疗，女性可以口服“
妇炎丸”治疗 。中药材中很多清热解毒药材，例如鱼腥草、芍药等，都相当于西医中的广谱抗菌素，杀菌能力很强，对于衣原体感染，有着很好的杀灭效果，虽然没有抗生素见效快，但是不会使病菌产生抗药性，无副作用，可以长期使用杀菌，持续有效。
