由于支原体对抗生素的耐药性有日渐增加的趋势，临床用药时应予以注意。有专家主张在治疗支原体感染时，为了减少或防止耐药株的出现，宜采用2～3种不同类型的抗生素联合治疗。同时，还可给予中药辅助治疗
总之，生殖道支原体感染用什么药是目前医学界争议颇多的问题。支原体是否是尿道炎、前列腺炎和盆腔炎等疾病的病因尚未得到证实。生殖道支原体感染不仅存在于性病病人和性病高危人群中，在健康人(包括婴幼儿)中也同样存在泌尿生殖道支原体的寄居。因此，生殖道支原体并非一定是性病，也并非都要治疗。生殖道支原体感染的治疗要视具体情况而定，切忌急躁草率。
